Bukod sa mga ospital at medical center, kilala rin ang Azerbaijan sa mga espesyal na pasilidad na gumagamit ng natural na yaman para sa paggamot. Ang Naftalan Oil Resort ay tanyag sa paggamit ng langis na Naftalan bilang lunas sa rayuma at mga sakit sa balat. Bukod dito, ang Lankaran Thermal Springs ay nagbibigay ng thermal bath at mud treatment na pinaniniwalaang nakatutulong sa iba't ibang kondisyon.
Mayroon ding mga espesyal na treatment center ang Azerbaijan para sa diabetes, respiratory disorders, at mental health. Mayroon din itong maayos na emergency health service na bukas 24 oras. Patuloy na pinapahusay ng gobyerno ang imprastraktura at kalidad ng serbisyong pangkalusugan para sa lahat ng mamamayan at turista.

